MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 1152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	TAT	2	6	298	303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
2	NC_001732	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
3	NC_001732	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	10954493
4	NC_001732	ATA	3	9	425	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
5	NC_001732	ATG	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
6	NC_001732	ACAA	2	8	500	507	75 %	0 %	0 %	25 %	10954493
7	NC_001732	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
8	NC_001732	GAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
9	NC_001732	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
10	NC_001732	AT	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	10954493
11	NC_001732	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
12	NC_001732	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
13	NC_001732	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
14	NC_001732	AAT	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
15	NC_001732	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	10954493
16	NC_001732	TAA	2	6	867	872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
17	NC_001732	ACT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954493
18	NC_001732	ATAA	2	8	932	939	75 %	25 %	0 %	0 %	10954493
19	NC_001732	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
20	NC_001732	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
21	NC_001732	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
22	NC_001732	TAT	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
23	NC_001732	CTTG	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	10954494
24	NC_001732	CA	3	6	1154	1159	50 %	0 %	0 %	50 %	10954494
25	NC_001732	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
26	NC_001732	ATA	3	9	1238	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
27	NC_001732	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
28	NC_001732	T	6	6	1286	1291	0 %	100 %	0 %	0 %	10954494
29	NC_001732	TTG	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954494
30	NC_001732	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954494
31	NC_001732	ATA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
32	NC_001732	CCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954494
33	NC_001732	ATC	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
34	NC_001732	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
35	NC_001732	TCA	3	9	1459	1467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
36	NC_001732	TTCT	2	8	1531	1538	0 %	75 %	0 %	25 %	10954495
37	NC_001732	CAAC	2	8	1592	1599	50 %	0 %	0 %	50 %	10954495
38	NC_001732	TC	3	6	1607	1612	0 %	50 %	0 %	50 %	10954495
39	NC_001732	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954495
40	NC_001732	ACC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954495
41	NC_001732	AGA	3	9	1948	1956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
42	NC_001732	AAC	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
43	NC_001732	TTAT	2	8	2007	2014	25 %	75 %	0 %	0 %	10954496
44	NC_001732	GAA	3	9	2019	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
45	NC_001732	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
46	NC_001732	CAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
47	NC_001732	ATCATT	2	12	2201	2212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954496
48	NC_001732	TTAA	2	8	2228	2235	50 %	50 %	0 %	0 %	10954496
49	NC_001732	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
50	NC_001732	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
51	NC_001732	ACAAAA	2	12	2294	2305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10954496
52	NC_001732	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
53	NC_001732	TCA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954496
54	NC_001732	ATG	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
55	NC_001732	GA	3	6	2340	2345	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
56	NC_001732	GTTG	2	8	2458	2465	0 %	50 %	50 %	0 %	10954496
57	NC_001732	AG	3	6	2550	2555	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
58	NC_001732	T	6	6	2563	2568	0 %	100 %	0 %	0 %	10954496
59	NC_001732	TGA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
60	NC_001732	GAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
61	NC_001732	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
62	NC_001732	CA	3	6	2657	2662	50 %	0 %	0 %	50 %	10954496
63	NC_001732	GA	3	6	2667	2672	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
64	NC_001732	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
65	NC_001732	TTGA	2	8	2726	2733	25 %	50 %	25 %	0 %	10954496
66	NC_001732	AG	3	6	2746	2751	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
67	NC_001732	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
68	NC_001732	TTTTA	2	10	2822	2831	20 %	80 %	0 %	0 %	10954496
69	NC_001732	GAG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
70	NC_001732	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954496
71	NC_001732	ATGATA	2	12	3045	3056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954496
72	NC_001732	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
73	NC_001732	TTG	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
74	NC_001732	AT	3	6	3116	3121	50 %	50 %	0 %	0 %	10954496
75	NC_001732	TTG	2	6	3147	3152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
76	NC_001732	GAT	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
77	NC_001732	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
78	NC_001732	AGA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
79	NC_001732	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
80	NC_001732	GGA	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
81	NC_001732	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954489
82	NC_001732	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
83	NC_001732	ATA	3	9	3301	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954489
84	NC_001732	A	6	6	3316	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	10954489
85	NC_001732	AG	3	6	3327	3332	50 %	0 %	50 %	0 %	10954489
86	NC_001732	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954489
87	NC_001732	GAAA	2	8	3372	3379	75 %	0 %	25 %	0 %	10954489
88	NC_001732	AAC	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954489
89	NC_001732	AGA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
90	NC_001732	TCCA	2	8	3833	3840	25 %	25 %	0 %	50 %	10954497
91	NC_001732	TA	3	6	3856	3861	50 %	50 %	0 %	0 %	10954497
92	NC_001732	TAT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954497
93	NC_001732	TCC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
94	NC_001732	CTC	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
95	NC_001732	CTTC	2	8	3969	3976	0 %	50 %	0 %	50 %	10954497
96	NC_001732	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	10954497
97	NC_001732	TTC	2	6	4075	4080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954497
98	NC_001732	AAT	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954497
99	NC_001732	TCCC	2	8	4574	4581	0 %	25 %	0 %	75 %	10954498
100	NC_001732	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
101	NC_001732	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
102	NC_001732	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
103	NC_001732	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
104	NC_001732	ATC	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
105	NC_001732	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
106	NC_001732	CCT	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954498
107	NC_001732	T	7	7	4923	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
108	NC_001732	AGT	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954498
109	NC_001732	CCCT	2	8	4965	4972	0 %	25 %	0 %	75 %	10954498
110	NC_001732	TGT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954498
111	NC_001732	TAA	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
112	NC_001732	TA	3	6	5125	5130	50 %	50 %	0 %	0 %	10954498
113	NC_001732	TGC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954498
114	NC_001732	AG	3	6	5262	5267	50 %	0 %	50 %	0 %	10954498
115	NC_001732	TAT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
116	NC_001732	GTG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954498
117	NC_001732	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
118	NC_001732	TCA	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
119	NC_001732	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
120	NC_001732	CTT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
121	NC_001732	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	10954498
122	NC_001732	CTA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
123	NC_001732	ATA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
124	NC_001732	ACT	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
125	NC_001732	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
126	NC_001732	TAA	3	9	5784	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
127	NC_001732	TCT	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
128	NC_001732	CCT	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954499
129	NC_001732	CAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
130	NC_001732	T	6	6	5880	5885	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
131	NC_001732	GAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
132	NC_001732	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
133	NC_001732	CT	3	6	5992	5997	0 %	50 %	0 %	50 %	10954499
134	NC_001732	AT	3	6	6001	6006	50 %	50 %	0 %	0 %	10954499
135	NC_001732	CTTC	2	8	6124	6131	0 %	50 %	0 %	50 %	10954499
136	NC_001732	TGC	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954499
137	NC_001732	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
138	NC_001732	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
139	NC_001732	TC	3	6	6270	6275	0 %	50 %	0 %	50 %	10954499
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271	NC_001732	TA	3	6	12100	12105	50 %	50 %	0 %	0 %	10954504
272	NC_001732	GAA	2	6	12118	12123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954504
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406	NC_001732	TTA	2	6	21598	21603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
407	NC_001732	GAT	2	6	21615	21620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
408	NC_001732	GTT	2	6	21638	21643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954508
409	NC_001732	TAT	2	6	21720	21725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
410	NC_001732	TA	3	6	21739	21744	50 %	50 %	0 %	0 %	10954508
411	NC_001732	TA	3	6	21760	21765	50 %	50 %	0 %	0 %	10954508
412	NC_001732	TGA	2	6	21812	21817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
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414	NC_001732	TTA	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
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433	NC_001732	GTT	2	6	23442	23447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954510
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437	NC_001732	CTAT	2	8	23647	23654	25 %	50 %	0 %	25 %	10954510
438	NC_001732	TAATT	2	10	23737	23746	40 %	60 %	0 %	0 %	10954510
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441	NC_001732	ACT	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954510
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449	NC_001732	ATT	2	6	24117	24122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954510
450	NC_001732	AT	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	10954510
451	NC_001732	TCTA	2	8	24177	24184	25 %	50 %	0 %	25 %	10954510
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480	NC_001732	CAACA	2	10	25805	25814	60 %	0 %	0 %	40 %	10954512
481	NC_001732	CAT	2	6	25843	25848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954512
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484	NC_001732	AT	3	6	25954	25959	50 %	50 %	0 %	0 %	10954512
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498	NC_001732	TCT	2	6	26589	26594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954512
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500	NC_001732	TTTG	2	8	26639	26646	0 %	75 %	25 %	0 %	10954512

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